Il y a deux groupes de concertation aux affaires autochtones constitués au sein de la gouvernance de l’Université de Moncton. Ceux-ci ont le mandat de guider et d’orienter les grands axes de l’engagement entre l’Université et les Premières Nations : Le Groupe de concertation des Wolastoqiyik traite des enjeux des Wolastoqiyik et le Groupe de concertation Mawiomi de ceux des Mi'kmaq.

Ces groupes de concertation ont pour objectif de créer des conditions propices à la collaboration et à l'établissement d'un dialogue entre les communautés des Mi'kmaq, des Wolastoqiyik et la communauté des Acadiennes et Acadiens. La mise sur pied de ces groupes de concertation vise essentiellement à donner suite aux appels à l'action de la Commission de vérité et réconciliation du Canada. Ils sont composés de représentantes et représentants de la Nation Mi'kmaq, de la Nation Wolastoqiyik et de la communauté universitaire.